Cuando se crea la Dirección General de Docencia, el 7 de julio de 1999 se determina que esta dirección estaba más alineada con las actividades de OTEP. Así, se transforma en el Departamento de Evaluación y Promoción del Personal Académico (DEPPA) integrado a la División de Desarrollo Docente (DDA). Este cambio no solo fue nominal, sino también de visión, pasando de una perspectiva administrativa a una verdaderamente académica. Desde entonces mejoró el sistema y procedimiento de evaluación docente y promoción. 

El DEPPA fue creado en 1999 como resultado de una reforma institucional en la USAC. Esta reforma tenía como objetivo fortalecer la calidad de la educación y mejorar la gestión académica en la universidad. El DEPPA, realiza una evaluación integral y objetiva del desempeño docente, considerando aspectos como la calidad de la enseñanza, la producción académica, la actualización, la formación continua, y la tutoría a estudiantes. Estos procesos buscan reconocer y premiar el trabajo destacado de los profesores, mediante un sistema de promociones, así como identificar áreas de mejora y brindar apoyo para su desarrollo profesional. 

Desde el 2000, el DEPPA ha reconocido la igualdad de puestos para docentes que laboran en distintas unidades académicas y ha valorado la calidad académica, la formación docente y los estudios de posgrado del personal académico, permitiendo a los docentes aspirar a posiciones superiores.